研究プロジェクト(1) タンパク質解析技術開発プロジェクト

1. 質量分析を用いた細胞プロファイリング
2. 質量分析を用いたタンパク質複合体（RNA/タンパク質も含む）機能解析
3. 逆相アレイを用いたタンパク質機能定量

研究プロジェクト(2) 基盤情報蓄積プロジェクト

1. がん細胞タンパク質情報の網羅的取得
2. リン酸化変動情報の網羅的取得
3. 抗体情報の網羅的取得

研究プロジェクト(3) 研究自動化プロジェクト

1. タンパク質解析サンプル処理の自動化
2. データ解析の自動化