Whole Exome Sequencing (WES) 解析

体細胞変異検出のための腫瘍部と正常部が揃っている症例の場合、体細胞変異検出・コピー数解析・TMB・MSI スコア・HRD スコアなどを算出します。また複数症例ある場合には、オンコプリントの作図やシグネチャー解析も行い、解析結果の概観を掴みやすくした HTML ファイルも作成します。

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  リード数情報

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  体細胞変異 VAF プロット

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  CNV

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  OncoPrint

Whole Genome Sequencing (WGS) 解析

WGSではWESの解析項目に加え、Structural Variations（SV）や全ゲノムレベルでのコピー数異常解析など、より包括的なゲノム解析を行います。

SV & CNV

RNA-sequencing 解析

発現量解析・融合遺伝子検出に加え、クループ間での変動遺伝子・スプライシング異常検出なども可能です。

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  Expression heatmap

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  TPM

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  Volcano plot

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  Fusion

カスタム解析

CRISPR スクリーニングなどの NGS で読んだリードのスクリーニングもお任せください。既存パイプラインでは対応困難な解析にも対応可能です。また Linux PC への解析環境セットアップも受け付けております。カスタム案件は相談事項が多岐にわたると思いますので、まずはお気軽にご連絡ください。